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愛爾眼科醫院集團共10家GCP機構，先后于2017年5月至2019年10月通過國家藥品監督管理局（NMPA） 資質認定，獲得“國家藥物臨床試驗機構”，認定專業為眼科，分別為武漢愛爾眼科醫院、長沙愛爾眼科醫院、廣州愛爾眼科醫院、遼寧愛爾眼科醫院、武漢愛爾眼科漢口醫院、北京愛爾英智眼科醫院、成都愛爾眼科醫院、重慶愛爾眼科醫院、上海愛爾眼科醫院、深圳愛爾眼科醫院。后依據國家政策要求又在NMPA進行了藥物及醫療器械臨床試驗機構備案， 現均可開展眼科藥物II~IV期、眼科醫療器械臨床試驗。2024年，新增備案山西愛爾眼科醫院、甘肅眼視光眼科醫院2家GCP機構。目前承接眼科GCP項目300+項，具有豐富的眼科臨床試驗經驗。此外， 博鰲愛爾眼科醫院是愛爾首家國際臨床研究基地，可開展高端特許藥械醫療服務、真實世界臨床研究。